Charcot–Marie–Tooth病是许多遗传性周围神经病的缩写。它可能是最常见的遗传神经系统疾病，每2500个人中就有1人受到影响。CMT是遗传异质的；已经鉴定出超过51个基因和基因座在发生突变时会引起CMT。这些基因编码的多种蛋白质参与细胞途径，包括蛋白质运输，轴突运输和蛋白质更新。因此，它们的鉴定对关注靶向药物的肿瘤基因检测网目前对脱髓鞘和轴突变性的分子基础的理解有帮助。这种进展的不利之处在于，临床医生越来越难以确定要筛查哪些基因作为个别患者神经病的潜在病因。不仅有很多基因可供选择，而且成本可能很高，如果评估一组基因，成本往往高达数千美元。但是，最近由多个小组进行的研究表明，超过90％的基因确定的CMT病例是由仅4个基因的突变引起的：PMP22；MPZ;GJB1和MFN2。此外，仔细的病史，家族史，神经系统检查和神经传导研究通常可以区分这4个基因，这可能是个别患者神经病变的原因。因此，从理论上讲，临床医生应该有可能在大多数CMT患者中就哪些基因进行检测做出明智的决定。
伦敦的一个大型CMT小组在评估他们诊所所评估的CMT的不同遗传类型时，将他们进行遗传诊断的成功率与大学以外将DNA样本转交给伦敦诊断的个别临床医生的成功率进行了比较。实验室。特别是在这样一个快速变化的领域，这些结果表明，具有遗传性神经病的临床专业知识不仅可以促进诊断，而且可以降低相关的成本。在1996年至2011年之间，关注靶向药物的肿瘤基因检测网在密歇根州底特律的韦恩州立大学经营一家大型CMT诊所。关注靶向药物的肿瘤基因检测网看到的一些患者以前曾接受过基因测试，而对于其他患者，关注靶向药物的肿瘤基因检测网指导了他们的基因测试。在此期间，可供测试的基因从少数几个增加到目前的51个以上。因此，测试实践在关注靶向药物的肿瘤基因检测网的诊所内外都不断发展。在这项研究中，关注靶向药物的肿瘤基因检测网比较了关注靶向药物的肿瘤基因检测网的测试模式多年来的变化，并且还将关注靶向药物的肿瘤基因检测网的测试模式与外部医生的测试模式进行了比较，以确定使用CMT1A作为指示性诊断的方式以及何时改变了这些做法。此外，关注靶向药物的肿瘤基因检测网有兴趣确定关注靶向药物的肿瘤基因检测网的经验是否也帮助关注靶向药物的肿瘤基因检测网降低了成本并促进了对患者的基因诊断。
通过搜索内部CMT诊所数据库，鉴定出具有基因证实的CMT1A诊断并在WSU的CMT诊所中被发现的患者。这些数据库由WSUCMT诊所开发并为WSUCMT诊所开发，包括自CMT诊所成立以来在该诊所看到的所有患者。纳入2001年1月1日至2009年12月31日期间进行PMP22重复检测阳性的患者。从临床数据库中提取的信息包括年龄，性别，神经传导研究，NCS日期，订购的基因检测，基因检测结果，订购医生和检测日期。家族史信息是通过图表审查收集的。为了进行分析，WSU以外的医生被归为一组，尽管有些人拥有肌肉营养不良协会的诊所或其他特定于基因的专业知识。该项目的所有方面均获得了WSU的人类调查委员会的批准。
分析包括了在9年时间内PMP22复制测试阳性的102位患者。其中，有57个由WSUCMT诊所下令进行基因检测，其余由外部医生下令。在57例CMT1A患者中，只有38例仅进行了PMP22复制测试。57名患者中有19名接受了2项或更多的检查，包括部分或全部检查。诊所的订购方式随时间而变化，与2001年和2002年单独进行PMP22复制测试相比，订购的面板数量更多，2003年的订购数量相同，而在2004年及此后的面板数量更少。在由外部医师下令进行基因检测后，在CMT诊所中发现了45例CMT1A患者。其中，有16个仅进行了PMP22复制测试，其余的则同时进行了2个或更多测试。外部医师测试实践随时间发生了变化，尽管这种变化发生的时间晚于CMT诊所测试实践的变化，并且在2008年发生的面板测试数量少于PMP22。为了调查临床专业知识是否可以减少与基因检测有关的成本，关注靶向药物的肿瘤基因检测网估算了进行的各种检测的大概成本。在这项研究中，美国CMT的基因检测成本在9年中发生了变化，每次检测的成本每年都在增加。为了进行分析，关注靶向药物的肿瘤基因检测网假设仅用于PMP22复制测试的费用为1000美元，而一次测试一个以上基因的费用为10,000美元。10,000美元是平均价格，因为一次执行3个基因测试的费用约为3000美元，而一整套多达16个基因的费用可能高达16,000美元。
关注靶向药物的肿瘤基因检测网考察了从2001年到2009年获得正面测试结果的人均成本。在2001年，WSUCMT诊所获得了5个面板，费用大约为50,000美元，而没有获得仅PMP22的测试。2009年，仅花费7000美元就获得了7个仅用于PMP22复制的基因测试，没有订购任何面板。在2001年，外部医生获得了3个小组和2个仅PMP22测试，费用约为32,000美元。2009年有3个PMP22订购了重复测试，没有面板测试，大约需要$3000。因此，在过去的9年中，WSUCMT诊所和外部机构都证明了定制基因检测的知识有所增加，随后检测成本也随之下降。根据基因测试实践的变化，关注靶向药物的肿瘤基因检测网观察到WSUCMT诊所比评估关注靶向药物的肿瘤基因检测网患者的外部医生更早开始进行PMP22复制测试。关注靶向药物的肿瘤基因检测网研究了两个队列中基因测试的总成本。在9年的时间里，WSUCMT诊所对这57例患者进行了基因检测，花费了大约228,000美元才能找到遗传原因。在同一时间范围内，对45名接受外部医生命令进行检测的患者进行基因检测的费用约为306,000美元。因此，再增加12名患者，WSUCMT诊所获得的基因检测将使保险公司和患者在9年内少花78,000美元。
在这项研究中，关注靶向药物的肿瘤基因检测网评估了在非专科诊所进行基因检测的专科诊所的价值。总体而言，与对关注靶向药物的肿瘤基因检测网的患者进行评估的外部从业人员相比，WSUCMT诊所提前了5年从执行面板测试转为仅进行PMP22复制测试。测试实践中这种变化的影响可以减少对患者，机构和保险公司的收费。至少从1999年开始，各个小组就已经描述了CMT的测试策略指南。提供了首批此类算法之一，使用中位运动神经传导速度≤42m/s进行PMP22复制/删除测试。通过建议对中位数MNCV<30m/s的人进行PMP22复制测试，进一步完善了该算法。同时在神经内科，肌肉与神经以及物理医学与康复领域发表了一项实践参数其中包含用于CMT中的基因测试的算法。在此表型是第一细分通过家族史，那么NCS的调查结果，并然后通过类型继承表观图案。该算法表明，对于具有阳性或阴性家族史且具有脱髓鞘神经传导研究和常染色体显性遗传的患者，应进行PMP22复制测试。2009年也是外部中心和WSU都订购仅PMP22的测试的一年。广泛传播有关重点测试的信息可能会影响整个社区，从而导致更好的测试实践。
发现他们在英国皇后广场的CMT专科中心比从外部机构送往实验室的患者样本更有可能找到患者的遗传原因。在关注靶向药物的肿瘤基因检测网的研究中，关注靶向药物的肿瘤基因检测网能够通过比外部医生更少的测试来发现个体CMT1A的遗传原因。看来专科诊所可以通过以下特定方式降低成本并提高测试效率：1、NCS通常在专科诊所进行，可用于告知基因检测。2、详细的家族历史记录将提供有关潜在继承模式的信息。3、专门诊所的临床医生对CMT的不同临床表型具有更丰富的经验和认识。基因检测的格局正在发生变化。目前，对于那些表现出NCS<35m/s且具有阳性家族史的脱髓鞘表型的患者，直接PMP22复制/删除测试仍然是最合适且最便宜的测试选择。但是，新的基因检测策略，包括下一代测序和全外显子组或全基因组测序，正变得越来越普遍且价格越来越便宜。目前，针对PMP22复制的多重连接依赖探针扩增分析可能是最敏感的测试，因为NGS/整个外显子组/基因组技术对获取拷贝数变异体的敏感性较低。但是，随着这种测试变得更加敏感并继续降低成本，关注靶向药物的肿瘤基因检测网很可能会看到利用这些更新技术的定向基因测试的变化。这将代表360°的变化-从更广泛的面板测试，到靶向基因测试，再回到面板测试，但以更经济的方式进行。
NGS/整个外显子组/基因组技术的主要挑战是，有可能识别出大量不确定临床意义的变体，即临床相关性未知的遗传变异。遗传测试结果中不确定重要性的变体的解释是一个挑战。这是因为即使许多基因的“突变”改变了蛋白质的氨基酸序列，它们也可能是良性的。这些变体因此可能难以解释，因为缺乏与疾病的明确关联。变体可能的临床意义取决于对基因/蛋白质功能的预期影响。确定变体是否与神经病变隔离可以帮助预测发病机理。遗传学专业人员通常具有帮助解释这些变体所需的经验和专业知识，这样可以提供适当的医疗管理和准确的患者咨询。关注靶向药物的肿瘤基因检测网的发现表明，特别是随着下一代技术的出现，专科中心将继续在针对CMT的基因测试中发挥作用。 |
