基因检测的过去，现在和未来 |
在过去的四年中，人类疾病的遗传学领域取得无与伦比的发现。特别是在发现与常见的复杂疾病如2型糖尿病，心肌梗塞，克罗恩病，乳腺癌和前列腺癌等风险相关的DNA序列变异方面，已经取得长足的进步。在2006年之前尽管有专职研究人员做出巨大努力，但只有少数序列变异体与这些疾病有关，而这些变异体在功能强大的研究中已通过复制得到充分验证。通过，2009年10月根据全基因组关联分析，指导目录。根据该数据库报告的相同标准，显示按出版年份显示的已复制疾病关联的总数。这些数字几乎肯定会继续以迅速的速度增长。这种突然的进步归因于全基因组关联研究的到来，这是通过至少四个关键发展的结合而实现的。
首先是有关人类基因组序列变异的丰富知识，这在很大程度上要归功于人类基因组计划和随后的HapMap项目。第二个是高通量微阵列基因分型技术的发展，该技术现在使研究人员能够同时且相对便宜地评估整个基因组中成千上万个单核苷酸多态性的基因型。第三是从许多患有目的疾病和来自同一人群的对照患者中收集DNA样本的可用性。促成GWAS成功的另一个因素是研究小组和期刊之间的紧密而富有成果的合作，它们为验证使用这种方法获得的疾病关联信号的验证制定了稳健而稳健的标准。与复杂疾病风险相关的序列变体的最新发现，代表理解其生物学任务的重要一步，其中关注卡马替尼的肿瘤基因检测网仍然非常无知。虽然一些新发现的关联是在已经怀疑在病因学中起作用的基因中发现的，但大多数都在与该疾病没有任何先前联系的基因中或附近。尤其是这些后期的发现，代表着重要的新出发点，需要对这些疾病的生物学和病因学进行更集中的研究。
尽管与疾病相关的新变种的发现率没有下降的迹象，但是有充分的理由相信，大多数挂得最低的果实已经被采摘了。考虑到病例和对照的现有样本量，并且存在于现有的微阵列基因分型平台中，这些是常见的序列变异，对疾病风险的影响很容易检测到。一些研究人员主张继续使用GWAS方法，采用更大的样本量来检测更常见的变体，但效果不大。其他人主张改变策略，指出可能在更多的GWAS中发现的变体的综合影响仅占有关疾病总体遗传力的一部分。已经提出对更加稀有的变体，拷贝数变体，表观遗传因子或未连接的序列变体之间的上位效应的关注。随着进一步的技术发展使全基因组测序和更全面的微阵列基因分型平台成为大规模疾病研究的现实选择，这些目标中的至少一些将在不久的将来实现。
显然，还有更多的发现，而且对关注卡马替尼的肿瘤基因检测网而言，显而易见的是，应遵循上述所有研究领域。但是，在遗传学家继续寻找与疾病相关的新序列变异体并试图确定他们已经发现的变异体的功能相关性的同时，他们必须解决与现有知识相关的同样迫切的实际问题。迄今为止，已经发现了超过1000种序列变异体，这些变异体与数十种主要复杂疾病的疾病相关性得到可靠的验证。在大多数当代人群中，这些疾病在发病率，死亡率和医疗保健费用中占相当大的比例。尽管大多数这些变体的功能影响尚不清楚，但它们与疾病的联系使它们具有对普通公众和卫生保健从业者的内在价值。这是因为它们在人群中的关联强度反映了它们可用于改善个体疾病风险预测的程度。
疾病风险分层是有效筛查程序的基础。它还在提高个人的健康意识，从而促进预防措施的采用和导致早期诊断方面起着重要作用。总体结果不仅是更健康的人口，而且是新兴医疗成本的下降，其中大部分是由于对可预防疾病的后期治疗所致。因此，可以通过添加最近发现的遗传因素来获得可观的额外健康益处和成本效益。尽管可以进行这种基因检测，但尚未被主要的卫生保健提供者常规采用。这可能部分是由于对此类测试或其科学依据缺乏了解，或由于财务或组织方面的考虑而产生的固有抵制。但是，也可以通过互联网直接向公众提供基因检测，这些测试通过健康方面的关注，好奇心以及对遗传学和祖先的娱乐兴趣的结合得到了积极肯定。
为不断发展的复杂疾病遗传学研究做出贡献，并打算在未来几年中保持这一领域的前列。但从2007年开始，一直是使用该知识来开发评估遗传风险的测试的领导者，包括针对医疗保健提供者的诊断产品形式和进行的个人基因组扫描，通过互联网直接出售给消费者。接下来，将概述基因检测的性质，以及关注卡马替尼的肿瘤基因检测网认为可以通过告知个人健康状况并鼓励他们在可能的情况下采取预防措施或寻求早期诊断的方法而带来的价值。
在继续介绍医疗保健提供者和公众当前可以使用的基因检测的种类之前，考虑基因组的性质可能会有所帮助。这可以帮助了解基因组可以提供什么样的信息，从而可以进行什么样的基因检测。在某些正常的环境条件范围内，基因组构成极其复杂的生物体组装和维护说明。对于人类而言，这些指令几乎全部由构成基因组的大约30亿个核苷酸的序列编码。可以将人类视为大量表型特征的集合，其范围从例如身高和皮肤色素沉着到不易察觉的特征，例如血液胰岛素水平或脑组织中淀粉样蛋白斑的形成。所有这些特征是来自基因组一个或多个部分的指令与某些环境因素之间相互作用的结果。大多数表型性状在个体之间表现出一定的差异，这反映DNA序列的潜在差异以及暴露于环境条件下的差异。在某些情况下，暴露于正常环境条件下的个体之间的差异仅归因于单个基因的DNA序列变异。完全由序列变体确定并根据孟德尔简单继承规则继承的特征的示例，是代谢氨基酸苯丙氨酸的能力，缺乏时会导致疾病苯丙酮尿症。然而，更常见的是，个体之间的性状变异可以追溯到许多DNA序列变异和环境因素。
使用基因检测正确预测诸如疾病发展等特征的能力取决于基因型和表型之间关系的性质。许多关键的人类疾病，即所谓的常见复杂疾病，都受到环境因素的严重影响。这意味着基因检测对这些疾病的预测能力将小于对诸如苯丙酮尿症等“简单”性状的预测能力。尽管如此，通过改善影响人口中大量个体的疾病的风险预测，潜在的健康和经济回报是巨大的。疾病可以定义为生理功能变化的一部分，超出正常范围，从而导致生活质量受损或过早死亡的可能性提高到不可接受的水平。疾病是大多数现有基因检测的重点，这并非巧合，因为迄今为止，疾病一直是人类基因型-表型关联研究的主要重点。但是，一旦收集到有关任何表型性状与一组序列变异之间的关联的可靠信息，就有可能进行基因检测以估计该性状的遗传倾向。实际上，市场上已经有几种基因检测，包括非疾病特征，例如眼睛颜色，男性型秃发，苦味觉和药物代谢。评论家经常在基因检测中忽略这些特征，但是随着关注卡马替尼的肿瘤基因检测网对序列变异对正常人的表型变异的功能影响的了解，它们可能在这一领域发挥更大的作用。除了能够评估特定表型性状的遗传易感性外，基因组还保存着所有人之间血统和谱系关系的记录。该信息在复制并从父母传给后代时被铭刻在基因组中，并以少量形式的突变和重组事件发生变化。在消费者基因检测的世界中，祖先一直是人们关注的主要领域，基于线粒体和Y染色体的单基因遗传材料的测试已经大量销售。
使用遗传标记来验证个人之间是否存在亲密家庭关系是一项相对琐碎的任务，通常在法医实验室和已经向公众提供的测试中执行。具有数十万个SNP的微阵列基因分型平台的引入可能会促进更强大的算法的开发，以明确测试个体之间更遥远的家谱关系。此类数据已经与人群遗传学最近开发的统计方法结合起来用于遗传测试，以提供详细的祖先和混血评估。这些分析的结果实际上是对个人与世界各地不同人群的族谱关系的总结分析。祖先的基因检测通常被评论员定义为休闲娱乐，并且在某种程度上与评估疾病风险的检测在质量上有所不同。然而，要牢记的是，在基因组中，大约功能和祖先信息被无情地交织在一起是很重要的。由于没有已知的功能，今天在祖先测试中使用的序列变体很可能会在明天被发现与疾病或医学相关性状有关。此外，在某种程度上，由于潜在的相关序列变异的频率不同，人群之间的疾病风险有所不同，因此可以得出结论，即对祖先的测试是对疾病遗传风险的有效测试，尽管是低功率测试。
目前，可以通过医疗保健提供者或直接向消费者的公司进行广泛的基因检测。确实，现在有如此之多的东西，不可能对它们全部进行全面的概述。首先，大多数测试是由大学或医院实验室在卫生保健规定的范围内进行的。它们基于与特定疾病密切相关的罕见且高度渗透性的序列变异。此类别中包括用于产前和新生儿筛查的检查，染色体异常的诊断检查，携带者检查以及针对特定疾病的预测性检查。随着时间的推移，出现提供此类测试的公司，在某些情况下是由上述大学或医院的人员建立的。早期的例子是基于BRCA基因的变异，为乳腺癌的预测性测试提供专利并在市场上销售。
通过医疗保健提供者进行的测试的一个共同点是，测试的变体很少且具有很高的渗透性。因此，一般人群中很少有人会从此类检测中获得阳性结果-例如，在筛查苯丙酮尿症突变的人群中就是这种情况。但是，在许多情况下，此类测试是根据临床诊断或家族风险提供的，这增加测试阳性结果的比例。对于获得阳性结果的个体，其影响往往是很高的疾病几率。因此，测试者通常会在测试之前和之后根据阳性结果会见遗传咨询师。在大多数国家地区，医护人员普遍使用稀有和高度渗透性序列变异的检测方法。许多人还根据APOE基因中更常见的变体对乳腺癌和阿尔茨海默氏病进行了预测性测试。然而，他们迟迟不愿或不愿利用最近一波稳健复制的GWAS发现带来的变种，这些变种与疾病风险增加相关，范围从1.05倍至7倍。尽管医疗保健提供者不愿对常见疾病进行基因检测，但越来越多的公司已经利用GWAS和其他基因研究的结果来设计主要通过互联网出售DTC的检测方法。当前，大多数可用的DTC测试都基于少数序列变异，并且侧重于特定的应用，例如血统，家庭关系或特定疾病的遗传风险测试。
通常，一家特定的公司会提供涵盖这些领域中一个或多个的几种此类小型测试。最重要的是，现在有几家公司提供DTC个人基因组扫描。这些产品主要基于大规模且具有成本效益的微阵列基因分型平台，该平台可测试整个基因组中的50万至100万个SNP，但在少数情况下，则使用更昂贵的全基因组测序。除了通过安全的个人网站帐户进行的一系列血统和家庭关系测验外，此类产品通常还为消费者提供许多疾病或特征的风险或易患性的估计。除了如此大量的SNP可以提供的测试范围外，针对消费者的个人基因组扫描的一个优势是，随着新发现的出现，他们可以获得所有测试的最新估计值。因此，测试的最初购买可以看作是一种投资，它以积累来自新发现的知识的形式产生兴趣。迄今为止，提供DTC个人基因组扫描的公司在更新其网站上提供的测试方面相当活跃。许多有关科学文献都集中在个人基因组DTC基因检测近期的评论文章扫描，特别是关于疾病的风险的担忧估计，他们提供给客户。这些担忧可以分为两个主要主题。
首先，对测试的有效性存在疑问。这里最普遍的批评是，由于在这些测试中使用的每个变体所赋予的风险往往较低，因此预测个体疾病风险的准确性也将较低。这样的注释将新测试与医疗服务提供者已经在使用的旧测试进行显式或隐式比较，这种方式具有很大的误导性。如果关注卡马替尼的肿瘤基因检测网采取心脏病等多因素疾病，那么不言而喻，就无法设计出具有与亨廷顿氏病一样强大的预测能力的基因检测，这种检测很少发生，仅由一个基因的突变引起，并且可以忽略不计。受环境因素影响。但是，认为基于GWAS发现的基因检测的预测能力微不足道且与临床无关，这是错误的。举个例子来说，测试在deCODEme的个人基因组扫描心脏发作，其中包括有强有力的证据八个独立的单核苷酸多态性的关联本病。仅此一项测试就可以识别出10％的欧洲体面人群中罹患心脏病的风险至少是该人群中普通人群的1.4倍。该组的平均相对风险为1.6。由于40岁以上的男性终生罹患心脏病的风险为42％,因此该测试可以识别出平均一生罹患最致命的疾病的男性风险为67％的男性.一生风险介于42％和67％之间。例如，在LDL胆固醇浓度最高的前五分之一人群中，患心脏病的风险仅为人群平均风险的1.3倍。因此，基于最近发现的序列变异的基因检测可以识别出罹患心脏病的风险增加的人，这是那些处于胆固醇曲线顶部的人的两倍。在这种情况下，请务必牢记，通过测量血清胆固醇来评估心脏病发作风险的能力已将心脏病学转变为预防医学的最重要领域。鉴于大多数工业化人群终生罹患心脏病的风险相当高，因此可以得出结论，即使每个人的预测能力略有提高也是很有价值的。
基因组扫描中包括的其他疾病中，前10％的人群中平均相对风险的可比估计是，例如，与年龄相关的黄斑变性为5.2，对于2型糖尿病为1.8，对于克罗恩氏病为3.0。有充分的理由相信，这些基因检测的预测能力将在不久的将来增加。一方面，关注卡马替尼的肿瘤基因检测网期望发现其他相关的序列变体。另一方面，由于当前测试中的风险评估通常仅按性别和种族进行分层，因此可以通过纳入其他相关背景变量来取得进展。在这两种情况下，都需要进一步的流行病学研究。但是，与某些评论员的观点相反，这些不是延迟的理由。到目前为止，在上述心脏病发作的例子中所反映的发现的价值明确地保证它们在基因检测中的用途。
评论员提出的关注的第二个主要主题涉及消费者了解和应对测试中疾病风险评估的能力。标的这些问题在某种程度上是家长式的，光顾认为，有关疾病的风险信息是危险的公众，除非医学专家亲自介导的。对公众的所谓危险包括对风险估计的过度理解造成的焦虑，这可能导致对医疗保健提供者的需求增加以及不必要的医疗程序。关注卡马替尼的肿瘤基因检测网尚不知道有任何证据支持这种观点，但至少有一些间接证据对此表示反对。但是，即使此类信息激起了焦虑，监管者或医学专家阻止其获取信息的权利也值得怀疑。考虑以下假设公司的类比，该公司根据年龄，性别和住址向个人提供有关其被抢劫，谋杀，被殴打或被盗的风险的可靠估计。毫无疑问，生活在城市地区粗糙，经济手段有限的人比生活在较富裕地区的人在所有方面面临的风险要大得多。这是防止个人寻求此类可能引起焦虑的信息的正当理由吗？评论家提出的另一个问题是，临床用途，也就是说，增加风险的知识可以通过预防或治疗减轻疾病负担的程度。尽管在DTC基因检测的讨论中经常提到此问题，但实际上仅在医疗保健范围内相关。因此，对于DTC基因检测，当与人们以自费方式寻求自己的信息的权利相平衡时，临床效用是次要的问题。鉴于此类测试符合公认的科学文献并遵守消费者法律，因此很难看到监管机构如何阻止公众购买这些产品。
关注卡马替尼的肿瘤基因检测网认为，DTC基因检测对消费者，向其提供产品的公司以及监管机构成功的关键是清晰和透明。无论测试报告疾病风险评估，血统分析或家谱关系评估，用于激励消费者购买测试然后解释结果的信息应尽可能清晰准确。特别是，疾病风险估计的概率性而非确定性必须是明确的，并且对于外行来说是可以理解的。一项关键任务也是以准确和负责任的方式使用科学文献，例如，仅包括与疾病相关的序列变异体，这些变异体已被可靠地复制。坚持此类标准的一种方法是通过透明性，即通过在科学文献中提供有关所使用的所有序列变体以及风险模型的参数值及其来源的信息。目前，大多数DTC个人基因组扫描提供商或多或少都采用了这种方法。
如果坚持这样的基本原则，关注卡马替尼的肿瘤基因检测网相信DTC基因检测可以为公众提供可观的价值，特别是当通过GWAS发现的基于疾病相关变体的检测无法通过医疗保健提供者进行时。从公共卫生的角度来看，使人们意识到自己的健康及其带来的风险，才有真正的预防价值。的确，建议通过应用DTC基因检测来预防生活方式的许多改变都可以使许多人受益，无论他们是否进行了这种测试。但是，正如大多数医疗保健提供者所知道的那样，即使面对医学专家的严厉建议，人们通常也不愿改变自己的生活方式。关注卡马替尼的肿瘤基因检测网认为，在将遗传风险因素添加到传统的生活方式风险因素中以激发人们采取预防措施时，结果会提供更大的行动动力。当然，从个人自主权的角度来看，即使人们选择不考虑有关疾病预防的建议，他们仍应寻求有关遗传风险的信息的权利。
强调许多提供DTC基因检测的公司的网站的教育性质也很重要。它们通常在数百个网页上包含有关疾病，血统和遗传发现的详细信息，以及用于提供结果的方法。通常，任何人都可以通过各种前端网页获得此信息，潜在的购买者可以在其中浏览作为客户将收到的信息的种类。因此，任何人都可以在无需支付测试费用的情况下，学到很多有关疾病，血统和遗传学的知识。无论是出于健康考虑，娱乐好奇心还是虚荣心而决定购买测试，消费者几乎可以肯定不仅会获得对遗传学的更多了解.关注卡马替尼的肿瘤基因检测网相信DTC基因检测在遗传学，使特权知识民主化和向公众传播方面起着关键的翻译作用。无论听起来多么陈词滥调，知识就是力量。尽管某些医学专家可能会抱怨患者拥有DTC基因检测的结果或互联网上有关疾病症状的信息，但关注卡马替尼的肿瘤基因检测网认为，知识渊博的公众是有权的公众。 |
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