【佳学基因-基因检测】简述单分子靶向测序
在过去几年中,第二代测序(NGS)的巨大进步使DNA测序的成本大大降低,尽管如此,人类全基因组测序和生物信息的解读成本依旧很大。第二代测序对全基因组测序和整个外显子测序非常有效,这就需要基于靶向测序方法,也就是说需要在测序前的样本制备过程中,应用目标序列捕获技术,杂交和多重PCR是贼常用的方法。
Yan Gao等发表在《自然》杂志上的研究非常更多的介绍了单分子靶向测序(SMTS),其原理是将靶向捕获和测序结合在一个步骤中,使用高分辨率显微镜,在单分子水平上检测标记在核苷酸上的荧光探针。将目的基因的特异性引物附着在流动池的表面上,通过与流式细胞中的引物杂交进行测序,而不需要利用PCR富集,与第二代利用靶向测序方法相比,单分子靶向测序简化了样品制备的复杂过程,避免了PCR扩增引起的偏差或误差。单分子测序技术提供了一个非常适合dota2吧雷电竞
基因突变检测、传染病检测、遗传病症筛查和产前诊断的新平台。
荧光染料标记核苷酸的选择对于单分子检测也是至关重要的,选择ATTO 647N染料标记核苷酸,对EGFR,KRAS和BRAF基因进行测序,并合成了野生型序列和含有突变与短缺失的两套用于测序的靶向DNA模板,并且在3'末端含有Cy3荧光染料。用532nm绿色激光激发标记Cy3荧光染料,并收集图像以定位靶DNA模板的位置。然后,把利用ATTO647N和DNA聚合酶修饰过的可逆终止子加入到流动池中,重复测序循环,直到达到所需的读取长度。在四次运行中,每个基座的平均替代误差率为0.52%。
单分子靶向测序相对于一代、二代测序优势如下:
1、样品制备程序简单快捷;
2、单分子靶向测序技术成本低;
3、周转时间和样品处理错误的风险低;
4、可直接对原始样品分子序列,而不是PCR扩增产物。
贼近,牛津Nanopore公司发布了他们的测试版本的测序仪,其可能达到超过100,000个碱基对的序列长度。与其他单分子测序技术相比,单分子靶向测序在一个流动池中直接捕获和测序目的基因是有优势的。
- 上一篇:没有了
- 下一篇:【佳学基因检测】40年基因测序催生基因解码时代的来临
- 【佳学基因检测】什么是MLPA基因检测?有什么优点?...
- 【佳学基因检测】如何将全基因组测序(WGS)基因检测数据定位到人的标准基因组上?...
- 【佳学基因检测】FISH基因检测中的探针类型选择...
- 【佳学基因检测】肿瘤基因检测生物信息分析注意事项...
- 【佳学基因检测】癌症基因组检测要点:一定要知道!...
- 【佳学基因检测】什么是基因组检测?...
- 【佳学基因检测】TP53突变基因检测...
- 【佳学基因检测】基因解码对Y染色体的进一步解密...
- 【佳学基因检测】肿瘤基因检测需要包括重复或反复区域的分析吗?...
- 【佳学基因检测】如何采用液体活检检进行细胞学检测与NGS测序...
- 【佳学基因检测】临床科研服务:GWAS课题中的统计分析...
- 【佳学基因检测】肿瘤靶向药物Regorafenib (Stivarga) 及其在结直肠癌治疗中的作用...
- 【佳学基因检测】ALDOA的群体遗传学结果对基因检测正确性的影响...
- 【佳学基因检测】SLC25A4的双生子遗传学分析结果简介...
- 【佳学基因检测】ASIC1的分子遗传学分析成果...
- 【佳学基因检测】ANXA6分子病理学成果概要...
- 【佳学基因检测】检验科医师晋升考试关于ADRA2C的知识...
- 【佳学基因检测】医学院硕士研究考试关于ACVR2A基因检测的知识要点...
- 【佳学基因检测】医学博士ANK1基因检测的知识结构准备...
- 【佳学基因检测】医学院专升本关于ADCYAP1R1基因检测的基本技能...
- 【佳学基因检测】病例分析会中需要知道的关于ACLY基因的知识...
- 【佳学基因检测】病案讨论中需要知道的关于AIF1的知识...
- 【佳学基因检测】质谱基因检测AGTR2基因存在基因突变该怎么理解?...
- 【佳学基因检测】飞行质谱基因检测发现ADRA2A有突变,严重吗?...
- 【佳学基因检测】核型分析发现NAT1突变了,是什么意思?...
- 【佳学基因检测】遗传学检测结果指出ALOX15突变,该找谁咨询?...
- 【佳学基因检测】高精度基因检测为什么包含ADD1基因?...
- 【佳学基因检测】基因检测包中为什么一定要有ACTA2基因?...
- 【佳学基因检测】基因检测时查看是否包含ADH1C重要吗?...
- 【佳学基因检测】NR0B1基因间序列存在突变是否需要阻断遗传?...
- 来了,就说两句!
-
- 贼新评论 进入详细评论页>>