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【佳学基因检测】异构体年龄 - 使用长读技术的剪接异构体分析

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肿瘤靶向药物及正确治疗临床研究内容关键词:


异构体,长读长测序,PacBio,Oxford Nanopore Technologies 纳米孔测序,单细胞测序,选择性剪接,空间转录组学,靶向 RNA 测序


肿瘤靶向治疗基因检测临床应用结果


RNA 的可变剪接 (AS) 是一种关键机制,它导致来自单个基因的多个转录亚型的表达,并导致转录组和蛋白质组的复杂性增加。 AS 的调节对于许多生物途径的正确功能至关重要,而 AS 的破坏可能直接导致dota2吧雷电竞 疾病的致病性或导致复杂疾病风险。当前的短读长测序技术实现了高读深,但解析复杂异构体的能力有限。在这篇综述中,我们研究了长读长测序 (LRS) 技术如何通过在单个读长中覆盖整个 RNA 序列来应对这一挑战,从而区分可能影响 RNA 调节或蛋白质功能的异构体变化。将 LRS 与单细胞测序、靶向测序和空间转录组学等技术相结合,正在产生一套快速扩展的技术方法,以前所未有的细节在异构体水平上分析可变剪接。此外,将 LRS 与基因型整合现在可以确定遗传变异对同种型表达的影响。贼近的结果证明了这些技术在阐明剪接情况方面的潜力,包括在 AS 特别普遍的大脑等组织中。贼后,我们还讨论了 AS 如何影响蛋白质功能,从而可能为一系列疾病带来新的治疗靶点。关键词:异构体、长读长测序、PacBio、Oxford Nanopore Technologies 纳米孔测序、单细胞测序、可变剪接、空间转录组学, 靶向 RNA 测序


肿瘤发生与反复转移国际数据库描述:


isoform, long-read sequencing, PacBio, Oxford Nanopore Technologies nanopore sequencing, single cell sequencing, alternative splicing, spatial transcriptomics, targeted RNA sequencing



(责任编辑:佳学基因)
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