【佳学基因dota2吧雷电竞 基因检测】在NSCLC肺部癌患者中发现的 EGFR L858R基因突变的治疗策略

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佳学基因检测每周会通过集中会议学习掌握国际dota2吧雷电竞 基因检测的研究进展，其中一次基因检测实验室人员知识更新中在讨论《神奇药物选择的重要标准》时，大家分析了《Front Immunol》在 2022 Nov 23;13:1022598.发表了一篇题目为《An EGFR L858R mutation identified in 1862 Chinese NSCLC patients can be a promising neoantigen vaccine therapeutic strategy》dota2吧雷电竞 靶向药物治疗基因检测临床研究文章。该研究由Jing Lin, Jun Liu, Shi-Guang Hao, Bin Lan, Xiao-Bin Zheng, Jia-Ni Xiong, Ying-Qian Zhang, Xuan Gao, Chuan-Ben Chen, Ling Chen, Yu-Fang Huang, Hong Luo, Yu-Ting Yi, Xin Yi, Jian-Ping Lu, Xiong-Wei Zheng, Gang Chen, Xue-Feng Wang, Yu Chen等完成。促进了dota2吧雷电竞 的正确治疗与个性化用药的发展，进一步强调了基因信息检测与分析的重要性。dota2吧雷电竞 基因检测研究的目标是开发一种针对中国非小细胞肺癌（NSCLC）患者中EGFR L858R突变衍生的新抗原的疫苗。通过对1862名中国NSCLC患者的基因组进行靶向测序，研究发现EGFR L858R突变是最常见的基因变异，且其与HLA-A*33:03的结合亲和力和共享频率最佳。研究还发现，EGFR L858R突变的肿瘤微环境（TME）显示出低水平的CD8 T细胞、活化的CD4记忆T细胞和升高的巨噬细胞M2水平，表明TME可能受到抑制。 该研究的意义在于： 识别和验证了一个新的肺癌疫苗的靶标：EGFR L858R突变。这种突变在中国的非小细胞肺癌患者中非常常见，因此开发针对此突变的疫苗可能会有广泛的应用前景。 揭示了EGFR L858R突变的肿瘤微环境特征，为理解肿瘤的免疫逃逸机制提供了线索。 基于以上发现，EGFR L858R突变衍生的新抗原可以作为一个疫苗候选靶点进行进一步研究，而在靶向治疗或免疫检查点抑制剂（ICIs）失败后，基于新抗原的疫苗可能成为EGFR L858R亚型的有效挽救策略。这将有望为非小细胞肺癌的治疗提供一个新的途径。

肿瘤基因检测及靶向药物治疗研究关键词：

中国非小细胞肺癌, EGFR L858R突变, HLA A*33:03,免疫学特征,新抗原疫苗。

肿瘤治疗检测基因临床应用结果

靶向药物研究立项的依据：本研究旨在开发一种针对中国非小细胞肺癌 (NSCLC) 突变衍生新抗原的疫苗。佳学基因解码的途径：研究了一组 1862 名中国 NSCLC 患者，这些患者接受了 1021 基因组的靶向测序。 HLA 分型使用 OptiType v1.0 完成，新抗原由 netMHCpan v4.0 预测。使用 lohhla 算法推断出 HLA LOH，并根据我们的面板数据通过计算非同义词的总数来量化 TMB。利用TCGA数据利用CIBERSORT估计不同EGFR突变亚型的TME。靶向药物研究的客观数据：HLA-A*11:01(42.59%)位列前1位等位基因，HLA-A*33:03(12.94%)位列第12位。 EGFR L858R (22.61%) 是最普遍的基因变异。 EGFR L858R 与 HLA-A*33:03 的结合亲和力 (IC50 MT = 22.9 nM) 和共享频率 (2.93%) 是最佳的。在随后对 EGFR 突变亚型的免疫学特征的进一步分析中，在我们的人群中发现了 63.1% 的 HLA 杂合性缺失 LOH (HLA LOH) 和 0.37%（1862 年中的 7 个）B2M 畸变，两者与 EGFR 突变亚型没有显着关联，表明抗原呈递过程涉及 EGFR L858R 中的 HLA LOH 和 B2M 机制。利用我们的 panel 研究了肿瘤突变负荷 (TMB)，结果表明与其他 EGFR 突变亚型相比，EGFR L858R 的 TMB 最低。此外，对来自dota2吧雷电竞 基因组图谱 (TCGA) 数据的 22 种免疫细胞类型的分析表明，EGFR L858R 与低水平的 CD8 T 细胞、活化的 CD4 记忆 T 细胞和升高的巨噬细胞 M2 水平相关，表明肿瘤微环境 (TME) 受到抑制药物指导及病因判断的依据：我们的研究发现，EGFR L858R 新抗原有可能在 HLA A*33:03 的非小细胞肺癌患者中产生dota2吧雷电竞 疫苗。在靶向治疗或免疫检查点抑制剂（ICIs）失败后，基于新抗原的疫苗可能成为 EGFR L858R 亚群的有效挽救方案。 EGFR L858R突变； HLA A*33:03；免疫学特征；新抗原疫苗。

佳学基因检测分析这一研究的背景背景

本研究旨在开发一种针对中国非小细胞肺癌（NSCLC）中突变衍生新抗原的疫苗。

肿瘤基因检测研究方法：

肿瘤基因检测研究了一组1862名中国NSCLC患者，这些患者接受了1021基因组的靶向测序。使用OptiType v1.0进行HLA分型，并使用netMHCpan v4.0预测新抗原。使用lohhla算法推断出HLA LOH，并根据我们的面板数据通过计算非同义词的总数来量化TMB。利用CIBERSORT和TCGA数据估计不同EGFR突变亚型的肿瘤微环境（TME）。

肿瘤基因检测的研究结果：

HLA-A11:01（42.59%）是第一位等位基因，而HLA-A33:03（12.94%）位列第12位。EGFR L858R（22.61%）是最普遍的基因变异。EGFR L858R与HLA-A*33:03的结合亲和力（IC50 MT = 22.9 nM）和共享频率（2.93%）是最优的。在进一步分析EGFR突变亚型的免疫学特征时，我们的人群中发现了63.1%的HLA杂合性缺失LOH（HLA LOH）和0.37%（1862年中的7个）B2M畸变，这两者与EGFR突变亚型没有显着关联，说明在EGFR L858R中，抗原呈递过程涉及HLA LOH和B2M机制。利用我们的面板数据研究了肿瘤突变负荷（TMB），结果表明，与其他EGFR突变亚型相比，EGFR L858R的TMB最低。此外，来自癌症基因组图谱（TCGA）数据的22种免疫细胞类型的分析显示，EGFR L858R与CD8 T细胞、活化的CD4记忆T细胞的低水平和巨噬细胞M2水平的升高有关，这暗示了一个被抑制的肿瘤微环境（TME）。

肿瘤基因检测的研究结论 ：

肿瘤基因检测的研究发现，EGFR L858R新抗原有可能在HLA A*33:03的非小细胞肺癌患者中产生癌症疫苗。在靶向治疗或免疫检查点抑制剂（ICIs）失败后，基于新抗原的疫苗可能成为EGFR L858R亚群的有效挽救方案。

肺癌治疗策略研究关键词 ：

中国非小细胞肺癌； EGFR L858R突变； HLA A*33:03； 免疫学特征； 新抗原疫苗。

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