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【佳学基因检测】基因检测CAV1 rs7804372 (T29107A) 多态性显示消化道癌的潜在风险

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佳学基因检测】基因检测CAV1 rs7804372 (T29107A) 多态性显示消化道癌的潜在风险



消化系统dota2吧雷电竞 风险基因检测导读:

背景:

Caveolin-1 (CAV1) 是caveolae 的重要结构成分,通过复杂的细胞信号通路调节细胞过程,并影响致瘤性。然而,CAV1 (rs7804372) 多态性在消化道dota2吧雷电竞 中的作用仍然没有定论。进行meta分析评估CAV1多态性对消化道癌易感性的影响,为正确治疗提供依据。

方法:

使用PubMed、EMBASE、Google Scholar和CNKI的数据库检索截至2020年6月已发表的关于CAV1(rs7804372)多态性和消化道癌易感性的研究。两名研究人员分别进行了研究筛选、数据提取和方法学质量评估。纳入和排除标准。使用 Review Manager 5.3 软件进行荟萃分析。

结果:

纳入了 6 项病例对照研究,包括 2477 名消化道癌症患者和 2477 名健康对照。汇总结果显示,CAV1 rs7804372(T29107A)多态性增加了该等位基因发生消化道癌的风险(T vs. A:优势比(OR)1.33,95%置信区间(CI):1.15-1.53​​,P  < . 01), 纯合子 ( TT vs. AA : OR 1.72, 95% CI: 1.31–2.26, P  < .01), 杂合子 ( TA vs. AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P  < .01) , 显性 ( TT vs. TA + AA: OR 1.32, 95% CI: 1.18–1.48, P  < .01) 和隐性比较模型 ( TT + TA vs. AA : OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P  < .01)。

结论:

消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队的研究结果表明,CAV1 (rs7804372) 多态性可能会改变消化道癌的发生,并且CAV1 (rs7804372) 的T等位基因或TT基因型的存在可能会增加消化道癌的风险。

关键词: CAV1,消化道癌,荟萃分析,多态性

 

1.简介

随着全球老龄化和不健康生活方式的发展,恶性肿瘤的发病率逐年增加。在全球范围内,消化系统恶性肿瘤的发病率位居癌症发病率前列。消化系统癌症,特别是食管癌、胃癌、结直肠癌和肝细胞癌,是全球关键的流行病学健康问题。与其他癌症相比,消化道癌患者不仅需要接受手术、放疗、化疗等综合治疗,还面临胃肠道功能障碍引起的营养不良、腹泻、便秘等不良反应,以及身体机能和自我调节等不良反应。人工造口引起的图像变化。这些问题显着影响消化道癌患者的预后。

Caveolin-1 (CAV1) 是小窝的主要膜蛋白,是质膜内陷的支架蛋白。 CAV1是细胞膜凹腔的重要结构成分,通过复杂的细胞信号通路调节细胞过程,并影响致瘤性。Caveolin-1基因家族的结构和功能在不同物种中高度保守,表明其对维持细胞功能至关重要。CAV1 通过磷酸化/去磷酸化信号与各种信号转导分子相互作用。它在胆固醇和脂质转运、膜转运、信号转导和细胞粘附中起重要作用。此外,CAV1参与细胞增殖、分化、凋亡、迁移、血管生成等多种信号通路的调控,与多种肿瘤的发生、发展、侵袭和转移有关。 CAV1 的致癌作用已在几种肿瘤中得到证实,这表明 CAV1 是一种新的肿瘤治疗靶点。多项研究探讨了 CAV1 多态性与乳腺癌、食管癌、结直肠癌、胃癌、易感性之间的关系]肝细胞癌、和其他癌症。然而,CAV1 rs7804372 (T29107A) 多态性和对消化道癌的易感性的结果仍然存在争议。因此,进行这项荟萃分析以验证CAV1 rs7804372 (T29107A) 多态性对消化道癌易感性的贡献,为正确的临床治疗提供证据。

 

2.方法

由于消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队的手稿是荟萃分析,因此不需要进行伦理审查。该荟萃分析是按照系统评价和荟萃分析的先进报告项目指南(PRISMA 声明)进行的。

2.1. 搜索策略和选择标准

通过PubMed、EMBASE、Google Scholar、CNKI、万方和VIP数据库在线检索CAV1(rs7804372)多态性与消化道癌易感性相关的文献,检索时间为2020年6月。检索时使用以下术语有价值的文章:[(CAV1) 或 (Caveolin-1) 或 (caveolin)] 和 [rs7804372 OR T29107A] [多态性或基因型或突变或变体] 和 [口腔或食道或胃或肝细胞或结肠直肠]。人工审查检索到的文章的参考文献以识别其他合格的文章。
1.所有已发表的研究都必须探索 CAV1 rs7804372 (T29107A) 多态性与消化道癌之间的关联;
2.病例对照研究;
3.可以直接获取或计算病例和对照中的基因型分布;
4.可以直接获取全文。
荟萃分析根据以下标准排除了研究:
1.动物或细胞系研究;
2.系统回顾、荟萃分析和重复报告;
3.基因型数据分布不可用。
 

2.2. 数据提取

使用指定的数据提取表,两名研究者独立完成研究筛选、数据提取、整理,对有争议的部分进行讨论和协商,贼终达成共识。数据提取主要包括先进作者姓名、发表年份、样本量、肿瘤分化程度、临床分期、淋巴结转移情况。New Castle-Ottawa 量表用于评估每项研究的质量。

2.3. 统计分析

Review Manager 5.3软件用于分析CAV1基因多态性的五种遗传模型,包括等位基因(T vs. A)、纯合子(TT vs. AA)、杂合子(TA vs AA)、显性(TT vs. TA + AA)和隐性比较模型(TT + TA与AA),其中TT是野生型等位基因的纯合子,TA是杂合子,AA是突变等位基因的纯合子。CAV1之间的比较(rs7804372) 多态性和消化道癌使用汇总优势比 (OR) 和 95% 置信区间 (CI) 表示。采用χ 2检验和I 2统计量判断研究间是否存在异质性;P >.10和I 2  <50%可以认为研究结果之间不存在统计学异质性,选择固定效应模型进行数据整合;P≤.10和I 2 ≥50%可以认为研究结果之间存在统计学异质性,采用随机效应模型进行数据整理。对照组的 Hardy-Weinberg 平衡使用 χ2评估测试,并比较对照组的预期和实际基因型频率。在这项荟萃分析中,P值≤.05 被认为具有统计学意义。

 

3. 结果

3.1 注册研究的特征

根据纳入和排除标准,共纳入病例对照研究6项,其中消化道肿瘤患者2477例,健康对照2477例。患者T基因位点阳性率为74.22%,健康对照组为68.21%(表​​​1和​​​2)。

表1:纳入研究的主要特征

先进作者

 

种族

 

癌症类型

 

案例/对照

 

测试方法

 

张 2014

 

亚洲人

 

胃癌

 

412/412

 

光谱法

 

林 2014

 

亚洲人

 

胃癌

 

358/358

 

逆转录聚合酶链反应

 

王 2014

 

亚洲人

 

食道癌

 

427/427

 

逆转录聚合酶链反应

 

许 2013

 

亚洲人

 

肝细胞癌

 

298/298

 

逆转录聚合酶链反应

 

鲍 2011

 

亚洲人

 

口腔癌

 

620/620

 

逆转录聚合酶链反应

 

杨 2010

 

亚洲人

 

大肠癌

 

363/362

 

逆转录聚合酶链反应

 

 

表 2:纳入研究中对照和病例的等位基因频率和基因型分布。

   

对照

病例

先进作者

 

n

 

TT

 

AT

 

AA

 

T

 

A

 

TT

 

AT

 

AA

 

T

 

A

 

张 2014

 

824

 

210

 

136

 

66

 

556

 

268

 

239

 

134

 

39

 

612

 

212

 

林 2014

 

756

 

192

 

133

 

33

 

517

 

199

 

188

 

135

 

35

 

511

 

205

 

王 2014

 

854

 

221

 

166

 

40

 

608

 

246

 

259

 

143

 

25

 

661

 

193

 

许 2013

 

596

 

152

 

98

 

48

 

402

 

194

 

166

 

93

 

39

 

425

 

171

 

鲍 2011

 

1240

 

306

 

206

 

108

 

818

 

422

 

363

 

193

 

64

 

919

 

321

 

杨 2010

 

724

 

179

 

120

 

63

 

478

 

246

 

216

 

117

 

29

 

549

 

175

 

总计

 

4954

 

1260

 

859

 

358

 

3379

 

1575

 

1431

 

815

 

231

 

3677

 

1277

 

 

3.2. 异质性检验

χ 2检验和I 2统计量用于评估纳入研究的异质性。结果表明,杂合比较模型(TA vs AA)和显性比较模型( TT vs TA + AA)存在统计学异质性,固定效应模型用于评估这些比较的合并OR和95% CI。在等位基因( T vs A)、纯合比较模型(TT vs AA)和隐性比较模型(TT + TA vs AA )中未发现统计异质性),随机效应模型用于评估这些比较的合并 OR 和 95% CI。

3.3. 敏感性分析和发表偏倚

进行敏感性分析,以评估每项研究对整体结果的影响,方法是逐个排除每项研究。结果表明,没有独立研究对汇总的 OR 产生显着影响。漏斗图用于评估发表偏倚。漏斗图没有显示出任何明显的不对称性(图​​​1)。

图1:发表偏倚的漏斗图。漏斗图用于评估研究的发表偏倚。漏斗图的形状没有显示主导模型中显着不对称的任何证据。

3.4. CAV1(rs7804372)多态性与消化道癌易感性的Meta分析

关于CAV1 (rs7804372) 多态性与消化道癌之间关系的荟萃分析结果总结在(表​​​

(表3和图2–6) 总体汇总结果显示,等位基因 ( T vs A : OR 1.33, 95% CI: 1.15–1.53, P  < .01)、纯合子 ( TT vs AA : OR 1.72 ) 中CAV1 (rs7804372) 多态性的风险增加, 95% CI: 1.31–2.26, P  < .01), 杂合子 ( TA vs AA : OR 1.47, 95% CI: 1.21–1.78, P  < .01), 显性 ( TT vs TA + AA : OR 1.32, 95 % CI:1.18–1.48,P  < .01)和隐性比较模型(TT + TA vs AA: OR 1.61, 95% CI: 1.26–2.07, P  < .01)。

表3:Cav-1 rs7804372基因多态性与消化系统肿瘤易感性的Meta分析

   

关联测试

异质性检验

基因型

 

n

 

OR (95%CI)

 

Z

 

P

 

χ 2

 

P

 

I2

 

T与A

 

9908

 

1.33

 

3.92

 

<.01

 

12.83

 

<.01

 

61%

 

TT 与 AA

 

3280

 

1.72

 

3.90

 

<.01

 

10.60

 

<.01

 

53%

 

助教与机管局

 

2263

 

1.47

 

3.92

 

<.01

 

5.75

 

.33

 

13%

 

TT 与 (TA+AA)

 

4954

 

1.32

 

4.87

 

<.01

 

6.80

 

.24

 

26%

 

(TT+TA) 与 AA

 

4954

 

1.61

 

3.81

 

<.01

 

9.33

 

.10

 

46%

 

 

图 2:等位基因T与A基因型的森林图。总体汇总结果显示等位基因比较模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多态性风险增加( T vs A:优势比 1.33,95% 置信区间:1.15-1.53​​,P  < .01)观察到纳入的研究(I 2  = 61%,P  = .03)。结果表明,CAV1(rs7804372)多态性T等位基因携带者的风险是A等位基因携带者的1.33倍。

图 3:TT与AA基因型的森林图。总体汇总结果显示,纯合比较模型中消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多态性风险增加( TT与AA:优势比 1.72,95% 置信区间:1.31-2.26,P  < .01)。观察到纳入研究的异质性(I 2  = 53%,P  = .06)。结果表明,CAV1(rs7804372)多态性TT基因型携带者的风险是AA基因型携带者的1.72倍。

图 4:TA 与 AA基因型的森林图。总体汇总结果显示,在杂合比较模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多态性风险增加( TA与AA:优势比 1.47,95% 置信区间:1.21–1.78,P  < .01)。在纳入的研究中未观察到异质性(I 2  = 13%,P  = .33)。结果显示,CAV1(rs7804372)多态性TA基因型携带者的风险是AA基因型携带者的1.47倍。

图 5:TT 与(TA + AA)基因型的森林图。总体汇总结果显示,在显性比较模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多态性风险增加( TT vs TA + AA:优势比 1.32,95% 置信区间:1.18-1.48,P  < .01)。观察到纳入研究的异质性(I 2  = 26%,P  = 0.24)。结果显示,CAV1(rs7804372)多态性TT基因型携带者的风险是(TA+AA)基因型携带者的1.31倍。

图 6:( TT + TA ) 与AA基因型的森林图。总体汇总结果显示,在隐性比较模型中,消化道癌的CAV1 (rs7804372) 多态性风险增加( TT + TA与AA:优势比 1.61,95% 置信区间:1.26–2.07,P  < .01)。在纳入的研究中未观察到异质性(I 2  = 46%,P  = .10)。结果显示,CAV1(rs7804372)多态性(TT + TA)基因型携带者的风险比AA高1.61倍基因型携带者。
 

4 讨论

CAV1 是构成小窝蛋白的完整膜蛋白的关键成分之一。据报道,它与食道癌、前列腺癌、结肠癌、乳腺癌、膀胱癌、肺癌、等有关, 可以促进或抑制肿瘤的发生和发展。

根据癌症数据库中BioMuta-单核苷酸变异的结果,已记录了CAV1多态性的45个修饰残基和2个修饰功能残基,其中一些已被报道与消化道癌症相关。

Yang等新颖报道了CAV1(rs7804372)多态性与结直肠癌的相关性。他们的结果表明,CAV1(rs7804372)与结直肠癌的高易感性相关,与吸烟状况对结直肠癌易感性有共同影响,CAV1 (rs7804372)多态性的A等位基因可能作为早期诊断的潜在生物标志物,预测和癌症治疗的目标。Zhang等报道了CAV1(rs7804372)多态性与胃癌的相关性,他们的结果表明CAV1(rs7804372) 多态性增加了胃癌的易感性和风险。接受CAV1 (rs7804372) TT单倍型的患者比具有AT或AA单倍型的患者具有更高的胃癌风险和易感性。Bau等报道CAV1(rs7804372)与口腔癌有关,CAV1的A等位基因(rs7804372)对预防癌症的发生起保护作用,T等位基因可能是一个危险因素。CAV1 (rs7804372)的TT基因型可能与口腔癌的风险有关。此外,王等对于食道癌也得出了同样的结论。虽然得到了不同的结论,但林等人。报道​​CAV1(rs7804372)多态性与胃癌易感性之间没有相关性。Hsu 等人在台湾人群中评估了CAV1基因的六个单核苷酸多态性与肝细胞癌风险之间的关系。未观察到rs7804372多态性与肝细胞癌之间存在显着关联。由于CAV1之间的结果不一致(rs7804372)多态性与消化道癌易感性,消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队团队全面检索了所有已发表的关于消化道癌CAV1(rs7804372)多态性的研究,并进行了荟萃分析,以获得它们之间的综合相关性。

在消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队的研究中,贼终纳入了六项研究。为了更详细地概述CAV1 (rs7804372) 多态性与消化道癌之间的关系,使用了五种遗传模型。消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队的研究结果表明,CAV1(rs7804372)多态性与消化道癌的风险有关,并影响消化道癌的易感性。CAV1 (rs7804372)的T等位基因、TT基因型和TA会增加患消化道癌的风险。这意味着CAV1(rs7804372)多态性可以被视为消化道癌早期诊断、发展和预后预测的潜在生物标志物。

由于CAV1(rs7804372)基因多态性与消化系统肿瘤关系的研究报道较少,数据库检索和数据收集的局限性, CAV1(rs7804372)基因多态性与年龄、性别、临床病理特征的关系没有进行分析。需要更大样本的进一步研究来确认CAV1(rs7804372)基因多态性与消化系统肿瘤之间的关系。

总之,消化道肿瘤风险基因检测持续改进团队证实CAV1 (rs7804372) 可以作为消化道癌的有价值的遗传易感性标志物。CAV1(rs7804372)等位基因T的存在比等位基因A的存在消化道癌的风险更高。靶向等位基因A对于消化道癌症的早期诊断、预后预测和治疗具有潜在价值。


 

CAV1 rs7804372 (T29107A) polymorphism might be a potential risk for digestive cancers: A protocol for systematic review and meta analysis.

Chen P, Zhang YL, Xue B, Wang JR.

Medicine (Baltimore). 2021 Jun 18;100(24):e26186. doi: 10.1097/MD.0000000000026186.

PMID: 34128850 

 

 

 

(责任编辑:佳学基因)
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