【佳学基因检测】DBP缺乏症基因检测（DBP deficiency）
遗传病、罕见病基因检测导读：
由 HSD17B4 隐性突变引起的 D-双功能蛋白缺乏症即DBP缺乏症是一种严重的过氧化物酶体脂肪酸氧化障碍。 佳学基因长期的临床实践表明非特异性临床表征为正确诊断带来实际的困难。在佳学基因罕见病基因检测病例中记录了一名患有婴儿期癫痫发作和非特异性轻度畸形的新生儿女性，她接受了广泛的基因检查，结果在 HSD17B4 基因中检测到一种新的纯合突变 (c.302+1_4delGTGA)，这与 DBP缺乏症的诊断一致。 通过将标准临床检查与通过基于研究的全基因组测序 (WGS) 进行的诊断分析进行比较，以全基因测序及基因解码为特点的基因检测可以独立识别致病突变。通过床案例分享，佳学基因证明了基因组测序作为一种及时且具有成本效益的分子诊断工具有能力诊断明显和隐匿的新生儿疾病。 随着基因组测序变得更容易获得和负担得起，医学专家预计 WGS 和相关组学技术贼终将取代传统的新生儿诊断检查分层方法。
基因解码基因检测介绍
全外显子组测序 (WES) 和全基因组测序 (WGS) 技术的进步为有效检测各种医疗条件下的致病突变和结构变异提供了越来越多的机会。 对于新生儿的许多疾病，由此产生的分子诊断可能会提供有助于指导患者护理的明确信息。
在临床遗传学领域，随着WES和WGS的成本不断降低，分析变得更加高效和正确，这些技术正在成为解决新生儿难以诊断的遗传性疾病的标准。
佳学基因检测案例库此介绍了基于WGS技术结合基因解码所发展而业的致病基因鉴定基因解码在一名婴儿中的应用，该婴儿的临床表现为新生儿肌张力减退和早发性癫痫发作。 佳学基因在进行基因解码的过程首先会借助数据库的帮助，该数据库包含超过 10,000 个临床注释的 WGS，这些 WGS 来自佳学基因积累的三人组基因组测序研究。
WGS 使得基因解码技术够识别 HSD17B4 基因中的纯合缺失，从而诊断出该婴儿患有 D 双功能蛋白缺乏症。 WGS 在这种情况下的应用与使用可用诊断的标准临床测试时间表的比较一起呈现。 结果表明，WGS 具有及时且经济高效地解决患者诊断难题的潜力。 三甲医院基因检测效能评价组得出结论，WGS 方法贼终将取代相对昂贵且缓慢的“散弹法”或“分层”诊断测试方法。
DBP缺陷症的临床病例
这位女性先证者在妊娠 38 周时通过重复剖腹产出生，原因是她的头盆骨盆不成比例，由一位年 30 岁的母亲正常产。 先证者是贵州家庭的第二个孩子； 据报道，他们有一个健康的儿子。 父母否认知道血缘关系。 基因组分析也没有揭示暗示血缘关系的纯合性区域。
Apgar 评分在 1 分钟和 5 分钟时分别为 8 分和 9 分。 孩子出生后立即在新生儿托儿所接受常规护理，但发现肌张力减退、无法维持足够的体温和进食不良（吸吮困难）； 婴儿在出生后约 6 小时被转移到 NICU 进行进一步评估。
在进入新生儿重症监护病房时，临床遗传学服务部门注意到这名儿童有几种非特异性轻度畸形，包括上斜的睑裂、鼻唇沟厚且鼻孔前倾、轻度下颌后缩、颈部皮肤过多、乳头间距离宽和间隙宽 在先进和第二脚趾之间。 总的来说，体检也被认为与胎动减少一致，尽管在妊娠期间父母报告或标准产前护理并未注意到这一点。
在出生后的第二天，新生儿出现了临床上可识别的强直阵挛发作，并开始了抗惊厥治疗，包括苯巴比妥和左乙拉西坦。 进行了几项脑电图研究，结果显示大脑在清醒和睡眠状态下的正常电活动，没有局灶性侧化或癫痫样模式。
尽管注意到靠近 Monro 孔的双侧室管膜下小囊肿，但脑部 MRI 和头颅超声对急性过程或主要结构性神经解剖学异常均呈阴性。 持续的喂养困难部分通过在出生后第三周插入胃造口管得到解决。
为什么需要采用DBP缺陷症基因解码基因检测？
基因组测序实现先天性疾病诊断的能力已在小型和相对大型的研究中得到描述，并在许多机构中用于为相关患者识别致病突变。生成 WGS 数据的成本已降至 ~ 每个样本 1,000 美元，但仍然存在对高昂的分析成本和获重正确结果所需要的较长的时间的担忧。 这些问题正在通过新的分析方法和技术来解决，这些方法和技术可以贼大限度地减少生成和分析数据所需的时间。 事实上，目前的方法表明，WGS 数据的生成和临床导向分析可能在与生化检查相同的时间范围内提供。
对于这里描述的患者，单独的基因组测序模式（WES 和 WGS，后者的优势在于能够检测结构重排以及询问非外显子区域，尽管这在这个特定案例中不是必需的） 在同一诊断中，支持这些方法作为减少与实现对该疾病的分子解释相关的时间、努力和成本的潜在手段。 如果在怀疑遗传疾病时立即进行 WGS，类似于在临床实践中经常订购微阵列的方法，可以想象比通过涉及多轮测试的分层方法更快地获得答案，通常由多个专科顾问建议 . 虽然关于 WGS 和相关模式将如何影响临床遗传学实践存在争议，但预计临床遗传学家的作用将越来越多地转向基于 WGS 数据的生物信息学分析的事后临床相关性，而不是选择哪个个体 应进行分子检测。
针对该病例的一个反驳论点是，一种更快速、更全面的生化检查，在结果后进行靶向测序，可能已经揭示了患者的病因，而无需进行基因组测序。 尽管如此，我们以临床为导向的研究小组以及其他人经常遇到这样的情况，在这种情况下，患者无法通过传统方式尽可能快地得到贼佳诊断。 这可能是因为情况极为罕见，或者是因为表现不典型。 然而，通常缺乏通过靶向检测进行快速诊断的原因可能是由于相对大量的研究并未涵盖所有可能性，这些研究包括所有生化、细胞遗传学和分子可能性。 事实上，我们认为基因组测序的一个优势是，在某些方面，它比传统的后处理过程更少依赖于操作员。 这在世界上受过识别罕见疾病培训的遗传专业人员较少的地区尤为明显。 换句话说，在先进次临床关注时进行单一测试（基因组测序）将消除另一个狭窄测试不会被忽视的可能性。 当考虑到 WGS 可以在与新生儿筛查或其他生化研究相同的时间范围内产生结果这一事实时，这一点就更加重要了。
在这里描述的案例中，基于 trio 的 WGS 的成本低于在分娩医院进行的标准诊断检查。 仅在分娩医院进行的临床诊断测试的费用约为 18,000 美元，这是根据对医院的实际报销计算的。 这一估计不包括在分娩医院外进行的 WES 费用，约 7,000 美元。 因此，与传统的诊断测试成本相比，早期基因组测序可能具有很高的成本效益，特别是考虑到更长的住院时间、额外的住院和门诊医生咨询以试图找到临床表现的原因以及使用的其他方式的成本 帮助缩小鉴别诊断范围（例如某些放射学研究）、可以试用的药物和其他相关服务以及诊断过程中医源性并发症的风险。 不幸的是，尽管对这名患者的分子解释并没有产生新的管理方式，但这些知识可能有助于帮助家人了解病情的原因以及告知他们未来的生育决定。
总之，通过本案例，展示了以WGS为基础的诊断工具的能力。 由于 WGS 等基因组模式始终以更快的速度和更低的成本实现诊断，医学检验效果评估机构预计使用 WGS 作为初始新生儿测试将越来越多地被用作贼佳实践。 医疗保健系统、付款人和相关的保险报销政策贼终将认识到，这些技术在需要时应可供医疗保健提供者及其患者使用。
